花嶼位在望安島西北方，是澎湖縣最西方的島嶼，也是全台的極西，最高處約53公尺。 花嶼地形與澎湖其他島嶼相似，地質卻是不同，其他島嶼以玄武岩為主，而構成花嶼的岩石主要為安山岩，是由九千萬年前到五千萬年前形成，為澎湖群島最古老的島嶼；在長期的風化作用下，刻劃出了不同的岩石景觀。在退潮時，花嶼的東南側海蝕礁石上，可看到傳說中「仙腳石印」的左腳，與望安嶼天台山的右腳相呼應；島上還有夫妻石（情人石）、石觀音、石猴、老翁石...等岩石景觀。在花嶼山頂的花嶼燈塔，是花嶼的主要地標，日治時期因具軍事價值而興建，於昭和14年（1939年）完工，塔身為鋼筋混凝土白色圓形構造，塔高12.5公尺，是台灣最西的燈塔；目前裝有四等閃光燈，每5秒閃白光一次，光力1600支燭光，採無人（遠端）管理。